D-kloprostenolio natrio druska ir L-kloprostenolio natrio druska yra enantiomerai, o tai reiškia, kad jie yra vienas kito veidrodiniai atvaizdai ir turi skirtingą erdvinį atomų išsidėstymą. D-kloprostenolio natrio atskyrimas nuo natrio L-kloprostenolio paprastai apima chiralinio atskyrimo metodus. Štai du dažniausiai naudojami tokio atskyrimo būdai:
Chiralinė chromatografija: Chiralinė chromatografija yra plačiai taikomas enantiomerinio atskyrimo metodas. Tai apima chiralinės stacionarios fazės, kuri yra kolonėlė arba derva su chiraliniu selektoriumi, naudojimą. Chiralinis selektorius skirtingai sąveikauja su enantiomerais, todėl skiriasi jų sulaikymas ir atskyrimas. Kolonėlė užpildyta chiraline stacionaria faze, o D-kloprostenolio natrio ir L-kloprostenolio natrio mišinys leidžiamas per kolonėlę konkrečiomis judriosios fazės sąlygomis. Kai junginiai praeina per kolonėlę, jie skirtingai sąveikauja su chiraline stacionaria faze, todėl išsiskiria enantiomerai.
Fermentinė skiriamoji geba: Fermentinė skiriamoji geba yra dar vienas enantiomerų atskyrimo metodas. Jame naudojami fermentai, kurie selektyviai sąveikauja su vienu enantiomeru, paverčiant jį produktu, o kitas enantiomeras nepaveikiamas. Pavyzdžiui, fermentas gali selektyviai katalizuoti reakciją su D-kloprostenolio natriu, bet ne su L-kloprostenolio natriu. Naudojant šį reaktyvumo skirtumą, du enantiomerai gali būti atskirti. Fermentinis skyrimas gali būti atliekamas tirpale arba naudojant imobilizuotus fermentus ant kietų atramų.
Svarbu pažymėti, kad naudojamas specifinis atskyrimo metodas gali priklausyti nuo tokių veiksnių kaip enantiomerų savybės, norimas atskirto enantiomero grynumas ir tinkamų atskyrimo metodų prieinamumas. Be to, natrio D-kloprostenolio ir L-kloprostenolio natrio atskyrimą gali atlikti vaistų gamintojai ir tai gali apimti patentuotus procesus, būdingus jų gamybos procedūroms.